1989 年，林登伍德学院因在校学生人数低于 800 人而破产。当政府聘请丹尼斯·斯佩尔曼 (Dennis Spellmann) 担任新校长时，学院面临关闭的危险。斯佩尔曼立即开始实施变革，取消男女混合宿舍，强调课堂上“以价值观为中心”的方法，并取消终身教职。
该大学从 20 世纪 90 年代中期开始大规模扩建学术、住宿和体育设施，其中包括建造八个新宿舍楼、斯佩尔曼校园中心、卢布洛克体育中心和哈伦·C·亨特体育场，以及艾尔斯大厅和哈蒙大厅的扩建。引起学校争议的一个变化是2002年开始的“猪肉换学费”计划，旨在帮助农村家庭支付学费，大学接受牲畜以换取折扣。然后这些动物被加工并在学校食堂使用。当时，善待动物组织在圣查尔斯举行了一场小型抗议活动，以回应该计划。斯佩尔曼政府对入学人数增长的关注使林登伍德大学成为 20 世纪 90 年代中期至 2000 年代初中西部地区发展最快的大学。 2006 年，丹尼斯·斯佩尔曼 (Dennis Spellmann) 去世，此时该大学的捐赠已增至超过 5000 万美元。詹姆斯·埃文斯 (James Evans) 于 2007 年 2 月 9 日成为林登伍德的第 21 任总裁。
===近期历史===
在埃文斯的领导下，公司继续扩张。 J. Scheidegger 艺术中心是一座表演和美术中心，于 2008 年底开业，耗资 3200 万美元。该大学还建造了新的宿舍，并开始为大学校长建造新的住宅。 Evans Commons 的建设于 2009 年开始，并于 2011 年夏季竣工。2011 年，林登伍德大学成为林登伍德大学系统。 林登伍德大学贝尔维尔分校从卫星校园转变为单独认可的学院。 11月，中北部高等院校协会高等教育委员会向该大学通报了这一认证决定。根据新的认证，林登伍德大学贝尔维尔分校将保留与圣查尔斯校区相同的名称和管理委员会，圣查尔斯校区现在被认为是林登伍德大学系统的姐妹学校。到2010年，林登伍德大学的捐赠已达到1.48亿美元。次年初，林登伍德开始建造一个新停车场，以缓解校园拥堵。该大学宣布将在亨特体育场西区看台后面建造一个新的运动设施。这座占地 4,037 平方米（43,450 平方英尺）的三层建筑包括新的足球、男女足球、男女长曲棍球和曲棍球更衣室。它还设有一个新的学生运动员学术支持中心、教练办公室和俯瞰体育场的会议室。林登伍德计划建造一座新的行政大楼，以及更多的宿舍和校园设施，并将招生规模扩大到超过 …
