of Education）；1982年，其余12个系所整合为文理学院（College of Arts and Sciences）。不幸的是，在这段时期的后期，诺贝尔斯在任校长期间，存在着不少污迹，其中包括以其他名义发放体育奖学金，滥用机构基金等罪名，这导致学校被逼退出国家大学生体育联盟二级赛组，其本人也受到刑事犯罪的调查。
1992年5月，密西西比学院又并入了因招生人数下滑而被迫面临关闭的克拉克学院（Clarke College）。1990年代期间，学校进行多项扩建与整修工程，包括图书馆、多媒体中心、为护理学院服务的柯克罗夫特楼（Cockroft Hall）、A.E.伍德体育馆（A.E. Wood Coliseum）、以及位于杰克逊市中心的法学院大楼、新建了男女学生宿舍，并改建与扩建詹宁斯楼（Jennings Hall）与拉提默馆（Latimer House，一座后作为校友接待场所使用的维多利亚风格建筑）等设施。
豪威尔·陶德博士(Dr. Howell W. Todd)于1994年7月开始担任学校校长，其在任内致力于推动密西西比学院迈向21世纪现代化。为达成此目标，陶德博士推动多项校园硬体设施的改善计划，旨在维护并延续密西西比学院既有的建筑风格与特色。并在校内建筑下大作文章，修缮并改建了多座历史悠久的建筑，使得密西西比学院的校内建筑更富个性。
拉提默–韦伯宿舍（Latimer-Webb Residence Hall）、玛丽・纳尔逊宿舍（Mary Nelson Residence Hall）与惠廷顿宿舍（Whittington Residence Hall）完成整修与改建；纳尔逊楼（Nelson Hall）与校友楼（Alumni Hall）也进行了翻新；赛尔夫楼（Self Hall）、法尔楼（Farr Hall）与艾文楼（Aven Hall）同样接受修缮工程。除翻新工程外，学校亦于詹宁斯楼（Jennings Hall）设置多媒体语言实验室──外语学习中心（Foreign Language Learning Center），并于艾文艺术大楼（Aven Fine Arts Building）增建先进的隔音音乐练习室。
此后，包括男女学生宿舍、以及一个占地9,800平方米(106,000平方英尺)的健康中心，以及数学、电脑科学与化学综合教学大楼。此外，学校全面建置校园网路系统「MCNET」，提供校内行政单位、教职员与学生接入网际网路的服务，并作为内部沟通平台。学校并于此期间新建及翻修了橄榄球场，网球场，棒球场，垒球场，足球场，以及各训练使用场地。
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