1994 年 7 月 1 日，蒙大拿州重组了蒙大拿大学系统。比林斯的东蒙大拿学院、阿弗尔的蒙大拿北方学院和大瀑布城的职业技术中心失去了独立性，成为蒙大拿州立大学的卫星校园。尽管蒙大拿州的七所部落学院仍然独立（因为它们由主权国家资助），但国家要求它们将教学、运营和学术运作与蒙大拿州立大学和蒙大拿大学整合，以继续获得国家资助。
蒙大拿州立大学于 1993 年庆祝其百年校庆。为了庆祝百年校庆，蒙大拿州立大学出版了一本名为《为了人民的利益：蒙大拿州立大学百年校史》的大学历史书，该书由三位蒙大拿州立大学历史学教授杰弗里·J·萨福德 (Jeffrey J. Safford)、皮尔斯·马伦 (Pierce Mullen) 和罗伯特·里德尔 (Robert Rydell) 撰写。
在马龙担任校长期间，蒙大拿州立大学见证了“校园历史上最大的扩建之一”，建造了大量新建筑。其中包括耗资100万美元的百年购物中心（1993年）、耗资2200万美元的工程和物理科学大楼（1997年）、耗资1000万美元的山猫体育场翻修工程、耗资1350万美元的布里克布里登球馆翻修工程、耗资1200万美元的农业生物科学大楼（1999年）以及耗资750万美元的雷恩图书馆翻修工程（1999年）。马龙是一名狂热的体育迷，他的关注点不仅限于体育人员和体育设施。 1999年，他在经历了八个失败的赛季后解雇了山猫队主教练克利夫·海塞尔，并聘请了东华盛顿大学的获胜教练迈克·克莱默。 1999 年 10 月，在 NCAA 调查显示密歇根州立大学女篮主教练特雷西·希恩 (Tracey Sheehan) 和助理教练杰夫·马尔比 (Jeff Malby) 两名教练过度劳累并导致学生运动员受伤后，他解雇了这两位教练。
和他之前的威廉·蒂茨一样，马龙也努力推动教师和大学寻求并赢得联邦科学研究资助。联邦研究经费从 20 世纪 80 年代末的仅 1,300 万美元增加到 1999 年的 5,000 万美元以上。本科生课程进行了修改，入学人数在 1999 年达到 11,746 名学生的历史最高水平，伯恩斯电信中心也成立了。马龙受益于强劲的经济，缓解了蒂茨面临的许多财政压力。他扩大了校友筹款计划，并推动密歇根州立大学基金会加倍筹款。但立法机关并没有同意加薪。 1992年，他经受住了文员和行政支持人员的罢工。然而，他后来受到批评，因为他在没有资金完成项目的情况下启动项目，然后利用随后的建设危机筹集资金来完成项目。在他任职期间，学费翻了一番，激怒了学生，一些教师批评他愿意建造新建筑，却拒绝支付教学设备费用。
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