20 世纪 50 年代，随着艺术与科学学院和核中心的成立，该机构增加了更多课程。
波多黎各立法议会于 1966 年重组了波多黎各大学系统。这次系统重组导致其名称发生争议，更名为波多黎各大学 - 马亚圭斯校区，至今仍被用作该机构的正式名称。
2007年，UPRM授予女性的工程学位占所有工程学位的35.4%，是美国大学中比例最高的大学之一。波多黎各大学马亚圭斯分校是美国第二大西班牙裔服务机构。
2010 年，作为 2010-2011 年波多黎各大学罢工的一部分，校园举行了罢工。 2017 年，为了响应波多黎各财务监督和管理委员会削减大学系统的预算，校园学生投票加入波多黎各大学 2017 年罢工。
==组织==
UPRM 下设农业科学学院、艺术与科学学院、工商管理学院、工程学院以及继续教育和专业研究部。农学院设有农业实验站。
=== 行政委员会 ===
马亚圭斯校区的行政委员会由作为主席的校长、院长、从非当然议员中选出的两名学术参议员、参议员和一名当选的学生代表组成。大学校长是当然成员。董事会作为校长的咨询机构，制定校园发展计划，批准校长编制的拟议预算，并授予任期、晋升和休假。
§ 临时总理后来成为永久总理
===学术参议院===
UPRM学术参议院由行政委员会成员、图书馆馆长、咨询办公室主任、从院系中选出的代表（其总数不得少于当选当然成员人数的两倍）、图书馆和咨询办公室当选成员以及十名学生代表组成。学术评议会是学术界的官方论坛。其主要任务是参与大学法律结构内学术程序的制定。
==校园==
UPR-Mayagüez 校区占地约 315 英亩（1.27 平方公里）。校园拥有一个体育中心，其中包括健身房、举重室、舞蹈/有氧课程室、篮球场、网球场和排球场、游泳馆、户外运动场和 Rafael A. Mangual 体育馆。 Hotel Colegial 是唯一的校内宿舍，专为运动员保留。校园内设有两家自助餐厅、一家书店、一家大众银行分行、一家名为 La Cueva de Tarzán（泰山洞穴）的休息室和一个计算机中心，尽管几个学术部门也运营着自己的计算机实验室。经过十多年的规划，2016 年 MUSA 艺术博物馆在校园内落成。 2019年，工商管理学院开设了一家新咖啡馆。校园内还有一座名为 La Casilla del Caminero 的历史建筑遗址。
马亚圭斯校园总图书馆为校园社区以及马亚圭斯居民提供服务。
==学术界==
波多黎各大学马亚圭斯分校由四个主要学院组成：
农业科学学院
文理学院
工商管理学院
工程学院
UPRM …
