2006 年与科学和联合健康学院合并，成立科学与健康学院。
克利里校友及朋友中心以及墨菲图书馆改建项目于 1995 年竣工。校园内的建设工作继续进行，两年后，休闲鹰中心和赫施勒钟楼也竣工。赫施勒塔成为校园的焦点，也是传统“灯笼挂”的新家。
=== 21世纪===
世纪之交，UWL 发生了一些变化。考古大楼和实验室是对校园原有发电厂耗资 38 万美元翻修而成，于当年盛大开业。耗资990万美元的Wing技术中心翻修工程也在当时启动，并于2001年竣工。另一个重大变化是财政大臣库伊珀斯的辞职。她的临时职位由道格拉斯·哈斯塔德 (Douglas Hastad) 接替，道格拉斯·哈斯塔德于 2001 年被华盛顿大学系统董事会任命为该大学第四任校长和第九任校长。
2001-2002学年，学校运动队获得4项全国冠军、3项NCAA三级冠军（室内田径、室外田径、越野）和1项NCGA冠军（女子体操）。
2007年，乔·高（Joe Gow）成为威斯康星大学拉克罗斯分校第五任校长和第十任校长。他取代了道格拉斯·哈斯塔德（Douglas Hastad）。作为一名出色的吉他手，他接任校长后在卡特赖特中心的“Cellar”餐厅为学生表演。
大学预算中国家资助的比例有所下降。 1996年，学生支付了西伦敦大学教育费用的35%，国家支付了剩余的65%。到 2005 年，学生比例已增长至 51%，而州政府则缩减至 49%。该大学感受到了公共资金减少造成的压力。该大学的百年纪念活动和“增长与准入”议程都旨在提供必要的财政资源，以应对国家资助的减少。
新学术大楼 Centennial Hall 于 2009 年春季动工，并于 2011 学年秋季开放。该校耗资 4400 万美元建成，拥有 44 间教室、两个礼堂、学术咨询中心、咨询和测试中心、多元文化学生服务、国际教育办公室和学生支持服务。
2018 年，耗资 8200 万美元的 Prairie Springs 科学中心开业，作为附近考利中心的扩建项目。这座占地 187,000 平方英尺的建筑以 Paul Fleckenstein Trust 捐赠的 200 万美元命名，扩大了大学的科学项目设施和研究能力。该项目代表了更大的扩张计划的第一阶段。
2023年底，威斯康星大学系统董事会一致投票决定解雇乔·高（Joe Gow）的校长职务，并由临时校长贝齐·摩根（Betsy Morgan）取而代之。此次解雇是对高因在公共色情托管网站上发布他和妻子的色情视频而被曝光的回应。高表示，解雇他是对他言论自由权的侵犯，他后悔没有早点透露自己的秘密生活。高于 …
