(Laurence Chaderton) 和他的妹夫理查德·卡尔弗威尔 (Richard Culverwell) 代表米尔德梅 (Mildmay) 于 1583 年 6 月以 550 英镑的价格购买了这座前修道院，作为新学院的所在地，并于 1582 年 11 月 23 日将财产转让给米尔德梅 (Mildmay)。米尔德梅的基金会利用了现有的建筑物。建筑师是拉尔夫·西蒙斯 (Ralph Symons)，1588 年，新建筑落成并举办了落成庆典，米尔德梅也参加了庆典。
清教徒米尔德梅希望以马内利成为英国圣公会传教士的培训中心。根据托马斯·富勒的说法，米尔德梅在学院开业后来到法庭，女王对她说：“沃尔特爵士，我听说您建立了一个清教徒基金会”，米尔德梅回答说：“不，女士；我绝不会支持任何违反您既定法律的事情；但我已经立下了一颗橡子，当它变成一棵橡树时，只有上帝知道它会结出什么果实”。
与所有古老的剑桥学院一样，伊曼纽尔学院最初只招收男学生。 1979年首次招收女学生。
== 建筑物和场地 ==
在米尔德梅的指示下，原来的多米尼加修道士的小教堂被改建为学院的餐厅，而修道士的餐厅也变成了一座小教堂。 17 世纪末，学院委托建造了一座新教堂，这是由克里斯托弗·雷恩 (Christopher Wren，1677 年) 设计的剑桥三座建筑之一。雷恩的建筑开放后，旧教堂成为学院图书馆，直到空间不够用。图书馆于 1930 年迁至现址，占据南院一栋于 1911 年竣工的大型建筑，最初用作演讲室。图书馆于1974年进行扩建。
院内有一个大鱼塘，是修道院遗产的一部分。池塘里栖息着一群鸭子。
研究员花园内有一个游泳池，是修道士的沐浴池，使其成为欧洲最古老的沐浴池之一，据称也是英国持续使用的最古老的室外游泳池。花园里还有一棵东方梧桐树，据说它的寿命比该物种的典型寿命要长得多。
据称，该学院拥有英国唯一的私人地铁（地下通道），将主校区与北院相连，但事实上，牛津奥里尔学院在奥里尔街下方拥有自己的隧道，将岛址与主要学院建筑连接起来。牛津的博德利图书馆在布罗德街下方也有自己的隧道。
===皇后大厦===
女王大厦设有 150 个座位的剧院、接待室、研讨室以及音乐练习设施。女王大楼内的剧院经常被学院用于各种目的，例如讲座、音乐协会音乐会、招生开放日讲座，并且还是一个会议场所。女王大厦由建筑师迈克尔·霍普金斯爵士和帕蒂·霍普金斯爵士设计，采用科顿石建造。建筑设计将石材外墙的坚固性与地板的跨越能力和混凝土质量相结合。石灰岩外部是承重的，是第一座使用带有内部电缆的后张石材的建筑。屋顶采用铅装饰，屋顶和镶板广泛采用美国白橡木。该建筑于1995年落成。
==学生生活==
伊曼纽尔学院学生会 …
