1960 年，是一所招收有学术才华的学生的私立学院。基督教联合教会提供了财政援助。乔治·F·鲍曼 (George F. Baughman) 于 1961 年至 1965 年间担任第一任总统。
新学院于 1964 年向所有种族、性别和宗教信仰的学生开放，招收了 101 名学生的一流班级。教职人员包括历史学家和哲学家阿诺德·J·汤因比（Arnold J. Toynbee），他退休后加入了特许教职人员。
学校提供重视探究自由的文科教育，学生个人负责自己的教育，并通过独特的学术课程实施。
到1972年，已有超过500名学生在新学院学习。随着 20 世纪 70 年代的发展，通货膨胀威胁着该机构的经济生存能力。到 1975 年，学院已负债 390 万美元，濒临破产。当时，南佛罗里达大学（USF）表示有兴趣购买学院的土地和设施，在那里建立分校。该学校与南佛罗里达大学合并，成为公立大学内的一个独立的“高年级校区”。
在协议中，新学院董事会同意将当时价值 850 万美元的学校校园和其他资产移交给州政府，以换取州政府偿还债务并同意继续将学校作为南佛罗里达大学系统内的一个独立单位运营。该协议规定，新学院的每个学生将获得与南佛罗里达大学其他项目相同的资金。前新学院董事会成为新学院基金会，并被要求私下筹集资金以补充国家资金，以达到运行新学院所需的总额，约占新学院每年 200 万美元运营预算的三分之一。根据该协议，新学院更名为“南佛罗里达大学新学院”。南佛罗里达大学启动了共享海湾校园的萨拉索塔分校项目，两所学校开始了一种不稳定的关系，这种关系将持续二十五年，新学院和南佛罗里达大学通过其萨拉索塔分校项目共享校园。
2001年，它成为一所自治学院，成为佛罗里达州立大学系统的第十一所独立学校，作为州立系统的荣誉学院。作为 2001 年佛罗里达州公共教育系统重大重组的一部分，新学院断绝了与 USF 的联系，成为佛罗里达州立大学系统中的第十一所独立学校，并采用了目前的名称“新佛罗里达学院”。佛罗里达州立法机关正式指定新学院为佛罗里达州的荣誉学院。学校不同寻常的学术体系也被写入法规：“提供学习计划，让学生尽可能根据个人兴趣、价值观和能力设计他们的教育经历。”作为独立大学建设的一部分，南佛罗里达大学被指示将其设施从新学院校园搬迁，它于 2006 年 8 月 28 日这样做了，当时它在校园未开发的希捷部分为南佛罗里达大学萨拉索塔海牛分校开设了一个新校园。由于条件包括两个机构都不会在未开发的海湾财产上建立高地保护区，新学院在私立学院成立时由细分社区的捐赠独立拥有作为自然保护区的自然保护区，新学院分割了财产并允许南佛罗里达大学萨拉索塔海牛拥有位于城市边界以北、位于海牛县的部分保护区。新学院和南佛罗里达大学萨拉索塔海牛分校继续共享校园，直到新校区竣工，此后，图书馆等某些设施仍然共享。
2010-2011 …
