1847 年 9 月，弗朗西斯·高特莱 (Francis Gautrelet) 就任新政权，担任总统。从那时起，该机构一直在耶稣会士的指导下继续运作。
美国内战期间，许多接近征兵年龄的男孩被送到斯普林希尔。但许多学生希望成为战争的一部分。该学院最终组建了两个军事连。斯普林希尔的一些耶稣会教父成为了联邦的牧师。一名征兵人员试图将学院的所有四十名耶稣会兄弟征召入伍。学院院长高特雷特向里士满的助理战争部长发出了紧急信息，后者允许兄弟俩暂时缓征兵役。
在重建时期，学院招收中美洲和古巴领导人的儿子中的学生。在学生抱怨西班牙语正在挑战英语在校园中的主导地位后，耶稣会组织了一个西班牙-美国联盟。 1869年，一场大火烧毁了主楼。学生和教师不得不暂时搬迁到路易斯安那州大科托的圣查尔斯学院。约翰·昆兰和其他捐助者协助重建了学院，并于年底前在斯普林山重新开放。
随着入学人数的增加，昆兰厅、圣约瑟夫教堂、托马斯·伯恩纪念图书馆和莫比尔厅相继建成。 1935年，自1923年以来一直与学院不同的单位的高中被撤销。 1937 年，耶稣会研究室在高中腾出的空间内开放，几年后，圣心学院在学院毗邻的场地上开放。
第二次世界大战后，大量退伍军人的涌入对学院的设施造成了负担，学院在校园内建造了许多临时建筑来接待新生。应莫比尔大主教托马斯·约瑟夫·图伦 (Thomas Joseph Toolen) 的要求，该学院于 1952 年实行男女同校。
作为一所南方学院，Spring Hill 在其成立的前 124 年里不招收黑人学生。它在教育该地区的种植园主和奴隶主方面发挥了重要作用，特别是在路易斯安那州，那里许多富有的白人都是天主教徒。最终，该校于 1954 年 9 月招收了第一批黑人学生，几个月前，最高法院在《布朗诉教育委员会案》（Brown v. Board of Education，1954 年）中裁定公立学校的种族隔离违宪。范妮·E·莫特利 (Fannie E. Motley) 夫人于 1956 年成为该机构的第一位黑人毕业生。
即使起步较晚，斯普林希尔学院在阿拉巴马州非裔美国人的公民权利教育方面也相对较早。马丁·路德·金博士在 1963 年的《来自伯明翰监狱的信》中表示，他“赞扬该州的天主教领导人几年前整合了斯普林希尔学院”。
1957年1月21日晚上，十几辆漆黑的汽车驶入学院的主干道。三K党成员试图在宿舍Mobile Hall外立起一个浸有煤油的十字架。他们不知道自己在期末考试周期间在那里。大多数白人男性居民仍然醒着，正在准备考试，有几个人听到了敲击声。一旦接到警报，学生们从大楼的两端涌出，携带任何方便的武器物品——高尔夫球杆、网球拍、砖块、垒球棒——把惊慌失措的三K党成员吓得四散奔逃。第二天晚上，一支三K党小队又回来了，在学生们做出反应之前，他们在学院门口焚烧了一个十字架。第二天，一群男女学生在大学门口吊起了一个三K党成员的肖像，上面写着“三K党是胆小鬼”的牌子。
1963 …
