1762 年首次尝试在马萨诸塞州哈特菲尔德建立皇后学院,但一年内,由于马萨诸塞州州长弗朗西斯·伯纳德屈服于哈佛大学的压力,该学院反对在殖民时代的马萨诸塞湾省创建第二所高等教育机构,该章程被撤销。
1765年,西镇被合并为威廉斯敦。五年后,该镇的业主将威廉姆斯遗产执行人告上普通法院,对延迟建立免费学校提出争议,1795 年,马萨诸塞州立法机构最终授予了该学校的特许状。
威廉斯敦自由学校于 1791 年 10 月 26 日开学,共有 15 名学生。第一任校长是埃比尼泽·菲奇 (Ebenezer Fitch)。成立后不久,学校的董事会向马萨诸塞州立法机构请愿,将免费学校转变为收费大学。立法机关同意,并于 1793 年 6 月 22 日,威廉姆斯学院获得特许。它是马萨诸塞州成立的第二所学院。该学院成立时,维持种族隔离政策,拒绝黑人申请者入学。这项政策受到了被誉为第一位美国黑人诗人露西·特里·普林斯(Lucy Terry Prince)的挑战,她的儿子费斯图斯(Festus)因种族原因被拒绝入学。普林斯以健谈和雄辩家而闻名,她在学院董事会面前发表了长达三个小时的演讲,大量引用了圣经,但未能确保儿子入学。后来的学术界质疑这些事件是否发生,因为费斯图斯·普林斯可能因拉丁语、希腊语和法语掌握不够而被拒绝入学,所有这些都是当时成功完成入学考试所必需的,而费斯图斯长大的佛蒙特州吉尔福德当地学校很可能没有这些知识。
1806年,一次学生祈祷会引发了美国对外宣教运动。那年八月,五名学生聚集在斯隆草地的枫树林里祈祷。一场雷暴将他们驱赶到一个干草堆的避难所,随后聚会的热情激励他们将福音带到国外。学生们继续建立了美国海外宣教委员会,这是第一个向海外派遣传教士的美国组织。威廉姆斯校区使命公园附近的干草堆纪念碑纪念历史性的“干草堆祈祷会”。
到 1815 年,威廉姆斯学院只有两栋大楼和 58 名学生,并且陷入财务困境,因此董事会投票决定将学院迁至马萨诸塞州阿默斯特。 1821 年,学院院长泽法尼亚·斯威夫特·摩尔 (Zephaniah Swift Moore) 接受了他的职位,相信学院将向东迁移,因此决定继续搬迁。他带着15名学生,以阿默斯特学院的名义重新创办了学院。一些学生和教授决定留在威廉姆斯,并被允许保留当时相对一文不值的土地。摩尔在创建阿默斯特学院两年后去世,由威廉姆斯学院受托人希曼·汉弗莱 (Heman Humphrey) 继任。
爱德华·多尔·格里芬 …