Ruggles Smith）迫切希望挽救米德尔塞克斯大学。他了解到一个由以色列·戈尔茨坦（Israel Goldstein）博士率领的纽约委员会正寻求建立由犹太人资助的世俗大学。史密斯向戈德斯坦求助并提出了一项提议，即将米德尔塞克斯校园和特许权交给戈德斯坦委员会，以期希望他的委员会“拥有在批准的基础上重建医学院的明显能力”。戈德斯坦担心自己的医学院愿景失败，不过最终获得占地100英亩的校园。为此，他感到十分激动。该校园离世界上最主要之一的犹太社区纽约不远，而距离重要的犹太人口中心之一的波士顿也仅有9英里。戈德斯坦同意接受史密斯的提议，着手招募具有筹款经验的波士顿律师乔治·阿尔珀特（George Alpert）。
1946年2月5日，戈尔茨坦招募了著名犹太裔物理学家爱因斯坦，招致了全国对于这所新兴大学的关注。爱因斯坦相信，该大学将吸引来自世界各地、各领域的卓越青年。
=== 开学 ===
布兰戴斯大学于1948年4月26日宣布，国家希勒尔委员会主席艾布拉姆·萨查尔（Abram L. Sachar）当选为布兰戴斯第一任校长。萨查尔承诺布兰戴斯大学将遵循路易斯·布兰戴斯的学术诚信和服务原则。他还承诺，绝不会根据“种族，族裔或经济状况”作为配额去录取学生或者聘用教职工。
=== 早期阶段 ===
校园宿舍的建设始于1950年3月，其目标为90％的学生能够居住在校园内。运动场的建设始于1950年5月。1952年2月，开始建造可容纳2000个座位的圆形剧场。1953年，爱因斯坦（Einstein）拒绝了布兰戴斯大学授予荣誉学位的提议，写信给布兰戴斯大学校长阿布拉姆·萨查尔（Abram L. Sachar）说：“在布兰戴斯大学的准备阶段发生的一切根本不是由误会引起的，不能再加以改善了。”1953年成立近东和犹太研究系，是为美国大学最早的犹太研究学术课程之一。布兰戴斯（Brandeis）于1954年开设了研究生课程，即艺术与科学研究生院。同年，布兰戴斯（Brandeis）获得了充分的认可，加入了新英格兰学院与中学协会。截至1954年，布兰戴斯拥有22栋建筑和192英亩（78公顷）的校园。
=== 20世纪下半叶 ===
1969年1月8日，大约70名黑人学生进入当时的学生中心福特大厅，将所有其他人赶出了大楼，并拒绝离开。学生的诉求包括增加黑人教职员工的招聘配额、将黑人学生入学率从到学生4%提高到10%、建立美国黑人研究的一个独立部门，并增加黑人学生的奖学金。抗议期间，抗议者将学校改名为马尔科姆X大学，并全校分发带有新名称和徽标的纽扣。并列明十四项诉求，以提高少数族群在校内的发言权。在抗议期间，有超过200名白人学生在行政大楼的大厅举行了静坐活动。与此同时，学校正常课程并未受到影响。同一时期亦有其他大学的学生在校内开展了类似的运动，包括旧金山州立大学、明尼苏达大学、斯沃斯莫尔学院，切尼州立学院，皇后学院，和圣何塞州立学院。
时任校长莫里斯B.亚伯兰虽然承认“对这个国家对于黑人的冷漠和欺骗深感失望和愤怒”，但学生的行为是对大学的公开羞辱和冒犯。亚伯兰说：“学术自由本身受到了极大的侵犯。”同时教师亦谴责学生的行为。在抗议活动的第三天，亚伯兰提议成立三个委员会，以“详细阐明仍在分裂我们的那些观点”，但学生拒绝参与讨论。
抗议的第四天，米德尔塞克斯高等法院发布了一项临时限制令，要求学生们离开福特大厅。亚伯兰说他不会强行将学生从福特大厅驱逐，但他却说有65名学生因其行为被暂时停学。1月18日，黑人学生退出了福特音乐厅，结束了对这座建筑长达十一日的占领。在该抗议期间，没有发生暴力或财产损失。福特大厅于2000年8月拆除，并改建为夏皮罗校园中心，于2002年10月3日开放并投入使用。
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