R. Francis) 的管理下，该大学得到了重建，并进行了增建，塑造了现代机构。
火灾发生后，一些州居民试图将大学迁往更西边的锡代利亚；但哥伦比亚争取到了支持来保留它。这些柱子被保留作为历史校园的象征。它们被校园最古老的部分——弗朗西斯四方院所包围。广场南端是学术大厅的替代者杰西大厅，以理查德杰西（火灾时的大学校长）的名字命名。杰西厅建于 1895 年，设有许多行政办公室和杰西礼堂。广场周围的建筑物都是用红砖建造的，导致该地区被称为红色校园。 1910 年，乔治·凯斯勒 (George Kessler) 在“城市美丽” (City Beautiful) 场地设计中将这一地区规划为景观美化和步道。
在四合院的东边，后来于 1913 年和 1914 年为容纳新的学术项目而用白色石灰石建造的建筑被称为“白色校园”。 1908 年，密西根大学新闻学院成立，号称是世界上第一所新闻学院。
1923 年 4 月，一名黑人看门人被指控强奸了密苏里大学教授的女儿。詹姆斯·T·斯科特在布恩县监狱被镇民和学生组成的私刑暴徒绑架，并在校园附近的一座桥上被绞死。
1935 年底，林肯大学（距离杰佛逊市约 30 英里（48 公里）的一所传统黑人学校）的四名毕业生被密西根大学研究生院拒绝录取。其中一名学生劳埃德·盖恩斯 (Lloyd L. Gaines) 将案件提交给美国最高法院。 1938 年 12 月 12 日，法院以 6 比 2 的结果做出了具有里程碑意义的裁决，命令密苏里州接纳盖恩斯进入密西根大学法学院或提供同等地位的设施。 1939 年 3 月 19 日，盖恩斯在芝加哥失踪，情况可疑。 2006 年 5 月，该大学授予盖恩斯死后荣誉法学学位。1950 年，法院命令对本科生进行了整合，当时该大学被迫招收非裔美国人学习林肯大学未提供的课程。
1935年6月5日，大学为密苏里州南部邦联士兵建立了纪念碑；它通常被称为“同盟摇滚”。该纪念碑于1974年被拆除。
2015-16 年密苏里大学抗议活动之后，校长和系统主席因学生的种族投诉而辞职。此外，该校还第三次受到美国大学教授协会的谴责。
由于新冠肺炎（COVID-19）疫情的出现，该大学于2020年3月11日停课，并于8月恢复面授教学。
==校园==
密苏里大学的校园占地 1,262 英亩（2.0 平方英里；510.7 公顷），位于哥伦比亚市中心以南，是一个植物园。 1999 年，该校园被正式指定为“密苏里州植物园”，表彰其收藏的 …
