5%，并将所有教员的工资削减 10%，其中包括伯内特。 1933 年的大部分时间里，摄政委员会和内布拉斯加州立法机构之间就资金问题展开了一场漫长而激烈的斗争，该州最初建议在已经削减的基础上，再全面削减 20% 以上的预算，以优先为农民提供资金。董事会拼命争取校友和选民支持预算斗争，并最终通过谈判为 1933 和 1934 财年制定了一套更为温和的削减方案。 1935 年下一轮大学资助之前，农作物价格略有回升，这意味着国家愿意将国立大学的预算提高到大萧条初期的水平。为了应对大萧条期间缺乏可用的国家资金，内布拉斯加大学基金会于 1937 年成立，作为学校的主要筹款机构。
在这十年的大部分时间里，缺乏资金、工资减少以及许多大学活动的取消导致行政部门、教师和学生之间普遍紧张。尽管伯内特自己减薪，但他却不受教职员工的信任，他的声誉也从未完全恢复。他于 1938 年辞职，同年内布拉斯加州学生会在 14 街和 R 街的拐角处成立。
董事会选择西弗吉尼亚大学校长昌西·塞缪尔·鲍彻接替伯内特。大萧条仍在继续，为了应对大学不及格学生数量不断上升的情况，鲍彻制定了国立大学的第一个入学标准。欧洲第二次世界大战爆发时，鲍彻敦促学生和教师保持中立。即使在美国参战之后，他也鼓励大学像往常一样“继续下去”。然而，入学人数的直线下降和强烈的民族热情意味着学校无法长期保持“中立”，并开始向美国陆军提供空置的大学建筑用于训练和庇护。内布拉斯加州很快加入了陆军专业训练计划，校园变得杂乱无章，因为士兵在被部署到海外之前“在居住期间非常随意地学习”。在 1944 年该计划被关闭之前，已有超过 13,000 名士兵接受了语言、医学或工程培训，以便开放曾被用作军营的爱图书馆。
整个 20 世纪 40 年代开设了许多新课程和项目，其中大部分是医学和工程领域的。战争结束后，大量学生涌入学校，其中许多是回国的退伍军人，寻求作为退伍军人教育的一部分接受教育。比尔为他们提供免费学费和住房援助。士兵的平均年龄比大学生的平均年龄要大，因此校园内的饮酒率（内布拉斯加州至今原则上仍然是一个无水校园）显着增加。许多高年级学生都已结婚生子，校园内缺乏足够的基础设施（特别是停车场），最终导致了 1948 年的学生骚乱。新任校长鲁本·古斯塔夫森（Reuben Gustavson）对战后校园里的恶作剧和“愚蠢行为”表示理解，因此深受学生们的喜爱。古斯塔夫森对战后的许多发展至关重要，包括校园宿舍的整合和学校医疗中心（现为内布拉斯加大学医疗中心）的规划。
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