为了将新大学的研究领域扩展到新技术，布朗很快购买了一家当地广播电台（KUOA），以广播基督教节目和他自己的布道。布朗以前曾广泛使用无线电，但他渴望将无线电资源交到大学手中。扩建的设施，例如扎根于20世纪30年代和1940年代的独特的大教堂群，造成了大学必须支付的费用。 JBU 于 1939 年开始收取学费，尽管金额很小，约翰·布朗开始意识到，从财务角度来看，学校的职业方面的成本比预期的要高。该大学严重依赖外部捐款来实现财务收支平衡。
=== 远离原教旨主义 ===
随着大学的发展，布朗继续在全国各地和广播中宣讲。他因对酒精、赌博、舞蹈和当时其他基督教原教旨主义问题的攻击而闻名。这使他与鲍勃·琼斯大学的创始人老鲍勃·琼斯关系密切，鲍勃·琼斯于 1937 年授予布朗荣誉博士学位。
20 世纪 40 年代，JBU 与基督教原教旨主义运动之间的密切联系开始减弱，因为该大学出人意料地摆脱了原教旨主义。约翰·布朗本人一直是跨宗派主义的支持者，并在二战后与青年基督组织和其他福音派组织结盟，JBU 发表了声明。约翰·布朗 (John Brown) 在 1948 年对这所学校的描述是“跨教派的，绝对是福音派的”，这在这方面非常有说服力。
=== 小约翰·E·布朗 (John E. Brown Jr.) 总统任期 1948–1979 ===
1948 年，老约翰·布朗 (John Brown Sr.) 放弃了对大学的控制（至少在名义上，因为他仍然担任董事会主席），他开始了一段急需的整合时期。第二次世界大战期间，学生人数锐减到一百多人，学校的高层领导几乎完全由布朗家族掌控。在第二个布朗时期，聘请了拥有更高学位的教授和管理人员，董事会开始发展为一个更加独立的机构，学生选举代表进入独立理事会。所有这一切都在 20 世纪 40 年代末开始发生。此外，该大学还开始建造其大教堂群，由被称为奥沙克大教堂的教堂圣所、科学大楼和图书馆组成，据称其建筑形式象征着“头脑、心灵和手”的教育理念。尽管 JBU 在此期间不断发展，但它仍然缺乏认证，其学生人数在 20 世纪 50 年代继续徘徊在 300 人左右。 1957 年创始人去世后，小约翰·布朗 (John Brown Jr.) 致力于提高 JBU 的教育质量。关键的一步是取消大学的职业学院。总统以 20 世纪 60 年代劳动力构成的变化为理由，取消了职业要求，并理解每个部门将提供实用的职业培训作为其课程的一部分。由于这些改革和其他改革，JBU …
