成为校长，并制定了课程，其内容截至 2020 年仍在使用。塞耶灌输了严格的纪律标准，制定了标准的学术学习课程，并强调诚实的行为。 他受法国理工学院课程的启发，应要求被派往法国理工学院学习两年，学习法国共和派的科技成果，并将其带回美国。他被称为“军事学院之父”，因其对军事学院的深远影响而在校园内树立了一座纪念碑。 USMA 最初是一所工程学院，于 19 世纪上半叶成立，培养的毕业生因对国家大部分最初的铁路线、桥梁、港口和道路进行工程设计而获得认可。在 1824 年伦斯勒理工学院成立之前，该学院是美国唯一的工程学院。它的工程课程非常成功，对内战之前建立的每所美国工程学校都产生了重大影响。
1835 年，在第二次塞米诺尔战争的第一年，陆军只有三名将军：温菲尔德·斯科特、埃德蒙·P·盖恩斯和托马斯·S·杰瑟普。陆军剩余的十四名将军只拥有名誉军衔，而且他们都不是西点军校的毕业生。直到 1835 年，获得委任的唯一途径几乎是通过学院，这引起了强烈的抱怨，并加剧了当时杰克逊民主派“摆脱学院的强烈愿望，杰克逊派确信学院正在孕育贵族传统。”
墨西哥-美国战争使该学院声名鹊起，毕业生首次在战斗中证明了自己。未来的内战指挥官尤利西斯·S·格兰特和罗伯特·E·李（后来也成为该学院的院长）在墨西哥的战斗中首次表现出色。总之，在战争中服役的 523 名毕业生中，有 452 人获得了战场晋升或英勇奖励。学校在 1850 年代经历了快速的现代化，领导内战双方的毕业生经常将其浪漫化为“旧西点军校时代的结束”。新的营房带来了更好的热量和燃气照明，而新的军械和战术训练则采用了新的步枪和步枪技术，并适应了蒸汽机带来的运输进步。随着内战的爆发，西点军校的毕业生填补了迅速扩张的联邦和南部邦联军队的将官队伍。 294 名毕业生担任联邦将军，151 名毕业生担任邦联将军。战时所有在世毕业生中，有 105 人（10%）被杀，另有 151 人（15%）受伤。内战期间，几乎两支军队的每一位著名将领都是西点军校的毕业生，而西点军校的毕业生在战争的 60 场重大战役中，每场都指挥过一方或双方的军队。
===内战后===
内战结束后，该学院因其毕业生所发挥的作用而享有前所未有的声誉。战后的岁月对于该学院来说是一段艰难的时期，因为它很难招收来自前南部邦联各州的学员并使其重新融入社会。 1868 年，第一批来自南方各州的学员重新入学，1870 年，第一位黑人学员、南卡罗来纳州的詹姆斯·韦伯斯特·史密斯 …
