(Guillaume Joseph DeBuey) 的资助下，由密尔沃基大教区第一位天主教主教约翰·马丁·亨尼 (John Martin Henni) 创建，成立于 144 年前，当时名为马凯特学院 (Marquette College)。该大学以 17 世纪传教士和探险家雅克·马凯特神父的名字命名。新成立的学院的首要任务是为该地区新兴的德国移民人口提供负担得起的天主教教育。马凯特学院的首批五名毕业生于 1887 年获得文学学士学位。1891 年至 1906 年间，学院聘请了一名全职非专业教授，许多课程由硕士生教授。到 1906 年，马凯特大学已授予 186 名学生文学学士学位、38 名学生文学硕士学位和 1 名学生理学学士学位。
===马凯特大学===
马凯特学院于 1907 年附属于当地一所医学院并迁至现址后正式成为一所大学。约翰斯顿大厅现在是大学传播学院的所在地，是新校园内建造的第一座建筑。马凯特大学高中原为大学预科部，同年成为独立机构。 1908 年，马凯特开设了一所工程学院，并购买了两所法学院，这最终成为其当前法律项目的基础。马凯特大学最初是一所全男性院校，1909 年招收第一批女学生，成为世界上第一所男女混合的天主教大学。到 1916 年，女学生已增加到 375 名；许多其他天主教机构在 1910 年代和 1920 年代开始采用类似的招生方法。
马凯特于 1913 年收购了威斯康星内科和外科医生学院，从而形成了马凯特大学医学院。在 20 年代以及二战后的几年里，马凯特大学迅速扩张，开设了新的图书馆、体育设施、教学楼和宿舍。随着法学院、商学院、牙科学院和文学院大楼的建设，学生人数也显着增加。马凯特大学被誉为美国第一个医院管理专业学位课程，首批两名学生于 1927 年毕业。尽管该大学发展前景光明，但财政拮据导致医学院于 1967 年从马凯特大学分离出来，成为威斯康星医学院。马凯特的金雪崩橄榄球队于 1960 年 12 月解散，篮球成为该大学最主要的观赏运动。
20 世纪 60 年代，一座 15 世纪早期的法国教堂 St. Martin de Seysseul 被转移到校园，据说该教堂与圣女贞德相连，并于 1920 年代被运往美国。毫不奇怪，它是威斯康星州最古老的建筑。
=== 1970 年代至今 ===
文科和理科研究生课程在过去十年就开始规划，并于 20 世纪 70 年代正式开设。 1977年，该大学庆祝男子篮球队战胜北卡罗来纳大学，夺得NCAA锦标赛冠军。
1994 …
