Forward”，这是大学未来50年发展的全面计划，重点是“卓越运营、卓越学术和建设未来”。
2012 年，耗资 4000 万美元的 Walter J. Hawrys 校园娱乐中心开业，紧接着，校园内的希尔顿花园酒店于 2013 年 5 月开业。弗雷大厅 (Frey Hall) 以校友罗伯特·弗雷 (Robert Frey) 的名字命名，在对前旧化学大楼进行翻修后于 2013 年开业。石溪大学体育馆 (Stony Brook University Arena) 进行了耗资 2,100 万美元的翻修，于 2014 年以岛联邦体育馆 (Island Federal Arena) 的形式重新开放。2015 年 7 月，耗资 4,080 万美元的新计算机科学大楼投入使用，占地 70,000 平方英尺（6,500 平方米）。名为 Chavez Hall 和 Tubman Hall 的新宿舍以及新的东区餐厅于 2016 年秋季开放。2019 年 1 月，Stony Brook Medicine 向公众开放了耗资 1.94 亿美元的癌症中心。
在拉里·纳萨尔丑闻发生后，斯坦利校长于 2019 年 8 月 1 日离开石溪分校，出任密歇根州立大学校长。教务长迈克尔·A·伯恩斯坦被任命为临时总统接替他的位置。 2020年3月26日，德克萨斯大学执行副校长兼教务长莫里·麦金尼斯被任命为石溪分校第六任校长，于2020年7月1日生效。
在 COVID-19 大流行期间，美国陆军耗资 5000 万美元在石溪大学校园内建造了临时野战医院。然而，这些床位在 2021 年就被拆除，从未使用过。耗资 6340 万美元的石溪联盟 (Stony Brook Union) 翻修工程在疫情期间完成，并于 2020 年开业。
===旗舰地位时代===
2022年1月5日，纽约州州长Kathy Hochul正式指定石溪大学和布法罗大学为纽约州立大学系统的两所旗舰大学。这一消息是在耗资一亿美元的新的多学科工程大楼落成之际宣布的。大约三周后，石溪分校宣布退出美国东部联盟，加入殖民地体育协会，并于 2022 年 7 月 1 日生效。同年晚些时候，杰出教授丹尼斯·沙利文获得了 2022 年数学界最高荣誉阿贝尔奖。
在2022-23年《美国新闻与世界报道》全国大学排名中，石溪分校排名第77位，这是有史以来的最高排名，也是石溪分校首次独占纽约排名最高的公立大学。次年上升至第58位。
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