2001 年初，大学和默塞德县都为修订后的校园和社区计划准备了各自的环境影响报告 (EIR)。与此同时，加州大学寻求联邦环境许可，以促进未来在原有高尔夫球场场地之外的扩建。
203 号提案的通过是一个关键时刻，标志着债券资金首次可用于在加州大学和加州州立大学系统中建造新建筑。 2001 年 3 月，大卫和露西尔·帕卡德基金会承诺提供超过 1100 万美元帮助加州大学收购弗吉尼亚·史密斯信托基金持有的全部 7,030 英亩土地。该协议导致建立了一个 5,030 英亩的保护区，其中包括重要的春季水池生态系统，而其余 2,000 英亩则指定为大学使用。其中，750 英亩的土地立即被划出纳入加州大学自然保护区系统。弗吉尼亚史密斯信托基金利用出售收益来加强其奖学金基金，偿还默塞德山高尔夫球场项目的未偿债务，并对周边社区的长期发展目标进行再投资。
尽管该大学最初计划保护约 5,030 英亩（2,040 公顷）的春天池栖息地，但这一数字后来扩大到约 6,428 英亩（2,601 公顷），最终正式建立了默塞德春天池和草原保护区，现在是更广泛的加州大学自然保护区系统的一部分。加州大学默塞德分校最终崛起的地点最初是在 20 世纪 90 年代初开发为公共高尔夫球场的。然而，当在原定地点发现濒临灭绝的神仙虾后，该项目被搬迁。由于高尔夫球场的土地已经受到干扰，因此免受许多环境问题的影响，事实证明这是一个更可行的替代方案。
加州大学默塞德分校于 1997 年在默塞德学院开设了一个小型行政办公室，并于 1999 年在退役的城堡空军基地的场地上建造了一个临时办公室。 2001 年，加州大学默塞德分校进一步扩张，在加利福尼亚州贝克斯菲尔德市中心的大学广场地区开设了卫星中心。该网站为克恩县和更广阔的圣华金河谷南部的学生提供外展和服务，包括大学预科课程和咨询。然而，作为加州大学默塞德分校管理费用和平衡运营预算的一部分，贝克斯菲尔德中心于 2011 年永久关闭。
===近期历史===
校园奠基仪式于2002年10月25日举行，本科生开学日于2005年9月6日，共有新生706人，转学生132人，研究生37人。第一夫人米歇尔·奥巴马为该大学第一届完整毕业班发表毕业典礼致辞。让米歇尔·奥巴马来校园的活动是由毕业班的学生发起的，他们写了 900 多张卡片邀请她来校园。毕业典礼是第一夫人的第一次毕业典礼演讲活动。
随着 2007 年至 2009 年经济大衰退的开始，加州大学受到了州政府预算削减的打击。在此期间，安德鲁·斯卡尔 …
