1961 年，也就是学校开学后的第二年，它融合并录取了第一位非裔美国学生欧内斯特·博格 (Ernest Boger)。博格于 1964 年毕业，获得学士学位。在心理学中。
1962年，学生们投票决定将“金婆罗门”作为大学的吉祥物，以该州的养牛业命名。 20世纪80年代初，吉祥物演变为“公牛”。
1963年，南佛罗里达大学举行了第一次毕业典礼。授予325度。
约翰·S·艾伦 (John S. Allen) 于 1956 年担任首任校长，直至 1971 年退休。在约翰·S·艾伦 (John S. Allen) 的领导下，该大学迅速发展。在此期间，大学迅速扩张，部分原因是 1964 年开始开设第一批硕士学位课程。艾伦因反对大学体育运动而支持南佛罗里达大学最初的座右铭“注重学习”而臭名昭著。 1959 年，他宣布学校将不设立运动队，但后来他改变了主意，南佛罗里达大学的第一支校队将于 1965 年开始组建。艾伦的最终遗产是成为第一个从头开始建立现代州立大学的人，他有一句名言：“作为一所全新的独立机构，南佛罗里达大学成为 20 世纪 20 年代美国第一个构思、规划和建造的同类新机构。 世纪”。如今，约翰和格蕾丝·艾伦行政大楼以大学创始校长和他的妻子的名字命名，里面设有坦帕校区的重要部门，包括学生事务部、招生欢迎中心和财务总监办公室。
USF 的圣彼得堡校区于 1965 年作为卫星校区开放。该地点当时被称为“海湾校区”，坐落在美国海军海事训练中心的旧址上。
1966 年 4 月 4 日至 5 日龙卷风爆发期间，南佛罗里达大学校园遭到 F4 龙卷风的破坏，该大学发电厂的冷却塔部分倒塌，其中一间宿舍的屋顶被掀掉。
=== 1970 年代 ===
1970 年，M. Cecil Mackey 成为该大学的第二任校长。在南佛罗里达大学任职期间，麦基开设了该大学的医学院、护理学院，并开设了有史以来第一个博士学位课程。程序。此外，麦基还致力于加强圣彼得堡校区，同时在萨拉索塔和迈尔斯堡开设新的卫星校区。在担任大学校长期间，麦基继续在办公室对面的会议室教授经济学课程。麦基首先为南佛罗里达大学创造了一个新的形容词：“都市大学”。如今，该术语仍用于描述南佛罗里达大学和大城市的其他大学。
USF 萨拉索塔-海牛分校成立于 1975 年，与佛罗里达新学院共用一个校园，后者后来也成为 USF 系统的一部分，然后再次成为一所独立大学。
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