世纪 80 年代 ===
20 世纪 80 年代，南佛罗里达大学在第三任校长约翰·洛特·布朗 (John Lott Brown) 的领导下成为一所主要的研究机构。在他任职期间，南佛罗里达大学研究生院于 1980 年成立。1986 年，布朗主持在南佛罗里达大学坦帕校区开设了 H. Lee Moffitt 癌症中心和研究所。 USF 成为美国第一所提供博士学位的大学。应用人类学博士学位，也是佛罗里达州立大学系统中第一所提供妇女研究学位课程的大学。 1988 年 1 月，南佛罗里达大学莱克兰分校开业。
1988 年 2 月 15 日，弗朗西斯·T·博尔科斯基 (Francis T. Borkowski) 就任该大学第四任校长。他担任校长五年，为大学的足球项目奠定了基础，在 Lifsey House 为南佛罗里达大学校长建立了校内住宿，并将几所学院合并为艺术与科学学院。
=== 20 世纪 90 年代 ===
贝蒂·卡斯特 (Betty Castor) 于 1994 年 1 月就职，成为该大学的第五任校长，也是第一位女校长。她担任南佛罗里达大学校长六年，直至 1999 年。在此期间，南佛罗里达大学已成为美国入学人数最多的大学之一。 1997 年，该大学开始了 NCAA 橄榄球的首个赛季。 1998 年，佛罗里达州董事会将 USF 命名为“研究型 1”大学。
=== 2000年代===
朱迪·根沙夫特 (Judy Genshaft) 于 2000 年被选为新任校长。在根沙夫特 (Judy Genshaft) 的领导下，该大学成为一所顶尖研究型大学（2018 年 6 月佛罗里达州理事会称其为“卓越”）和主要经济引擎，在她担任校长的最后一年，即 2018-2019 财年，年度经济影响达 37 亿美元。 2006 年，Castor 回到南佛罗里达大学，领导 Kiran C. Patel 博士全球解决方案中心；她于 2009 年辞职。该大学扩大了其全球影响力，于 2008 年在佛罗里达州开设了第一所孔子学院，并于 2011 年创建了 Genshaft/Greenbaum Passport 奖学金基金，为想要出国留学的南佛罗里达大学学生提供经济支持。在 Genshaft 的领导下，南佛罗里达大学连续跻身美国顶尖的退伍军人友好型大学之列。 2009 年，USF 成为美国第一所与美国退伍军人事务部合作的大学，利用新的 G.I. …
