1862 年辞职，原因是日益严重的财务问题、基督教联会和一神论受托人之间的宗派冲突以及他当选为哈佛大学校长。 1862年，学院关闭直至财务状况改善，并一直关闭至内战结束后。
====一神论阶段====
1865年，学院重新开放，现在由美国一神论协会管理。学院的财务状况似乎有所改善，一神论派在两个月内筹集了 10 万美元的捐赠款。该捐赠最初投资于政府债券，后来投资于房地产和木材。投资收益虽然表现良好，但仍不足以将学院维持在受托人期望的水平。 1873 年开始的长期萧条期间，一些校长因丧失抵押品赎回权而损失。1881 年至 1882 年间，学院再次关闭，以便收回捐赠资金。
==== 棒球里程碑 ====
1869 年，当辛辛那提红袜队作为第一支职业棒球队开始其首个赛季时，他们在现在的辛辛那提大联合航站楼所在地与安条克队进行了一场季前赛，后者被认为是俄亥俄州最好的业余俱乐部之一。这场比赛于 1869 年 5 月 15 日举行，辛辛那提队以 41-7 击败安提阿队。安条克原定于 1869 年 5 月 31 日举办本次职业巡回赛的第一场比赛，但因下雨而取消。因此，虽然安提阿没有参加第一场职业棒球比赛，但该学院确实声称主办了职业棒球史上的第一次雨赛。
=== 1900–1945 ===
世纪之交，学院的财务状况几乎没有改善。 1900 年，教师的年薪在 500 至 700 美元之间，在当时非常低，而校长的年薪为 1,500 美元。相比之下，霍勒斯·曼 (Horace Mann) 的年薪比四十年前高出 3,000 美元。在西蒙·D·费斯 (Simeon D. Fess) 1906 年至 1917 年担任总统期间，入学人数确实大幅增加。1912 年，他当选为美国众议院议员，并担任了五届任期中的三届，同时还担任安条克总统。
第一次世界大战对学院影响不大，西班牙流感流行期间虽然校园内有部分人感染流感，但没有造成死亡。 1919 年 2 月，基督教青年会尝试和平接管该学院，并提出如果安提阿能够成为美国基督教青年会的官方国立学院，则将筹集 50 万美元的捐款。基督教青年会的提议得到了学院受托人的积极响应，并一致投票通过，基督教青年会执行官格兰特·珀金斯担任学院主席。到了五月，帕金斯辞职了，并表示他不准备筹集必要的资金。
====摩根是====
1919 年 6 月，几位候选人被提交给受托人，其中包括阿瑟·摩根 (Arthur …
