VMI 学员坚守阵线，最终穿过一片开阔的泥泞场地，占领了一个联邦炮兵阵地，帮助南方联盟取得了胜利。几分钟之内，VMI 就造成 55 人伤亡，另有 5 名学员阵亡；学员们在学员指挥官和未来的 VMI 总监斯科特·希普上校的带领下投入战斗。希普也在战斗中受伤。
VMI 营（步兵和炮兵）因其在新市场战役中的表现而获得了机构战旗，这是仅有的五个获得此类荣誉的美国机构之一。
=====学员死亡名单=====
5 月 15 日，五名学员在行动中阵亡：
此外，战斗中的伤员中有五人后来伤重不治身亡：
另一位学员威廉·D·巴斯特 (William D. Buster) 于 1865 年 4 月在里士满服役期间死于伤寒。
==== 焚烧学院 ====
1864 年 6 月 12 日，即新马基特战役后一个月，联邦军队在大卫·亨特 (David Hunter) 将军的指挥下，炮击并烧毁了该研究所，作为 1864 年山谷战役的一部分。博物馆也被摧毁（但后来于 1870 年重新开放）。建筑物几乎被完全摧毁，VMI 不得不暂时在弗吉尼亚州里士满的救济院上课。南方联盟将军朱巴尔·A·厄尔利 (Jubal A. Early) 烧毁宾夕法尼亚州钱伯斯堡 (Chambersburg) 镇的原因之一是为了报复 VMI 遭到破坏。
===内战后===
1865 年 4 月，由于彼得堡即将陷落，里士满被疏散，VMI 立宪民主党军团也被解散。 1865 年 10 月 17 日，列克星敦校区重新开放，弗朗西斯·H·史密斯 (Francis H. Smith) 重新担任校长。 VMI 随后成为南方其他机构的典范，包括路易斯安那州立大学和德克萨斯农工大学。
战后，被称为“海洋探路者”的海洋学家先驱马修·方丹·莫里 (Matthew Fontaine Maury) 接受了 VMI 的教职，担任物理教授。约翰·默瑟·布鲁克也加入了学校。同样，戴维·亨特·斯特罗瑟（David Hunter Strother）曾担任亨特将军的参谋长并建议摧毁该研究所，他还担任弗吉尼亚民兵副官和 VMI 视察委员会成员。在该职位上，他积极推动并致力于重建工作。斯科特·希普 (Scott Shipp) 曾领导新市场的学员，并于 1890 年成为该校的第二任校长。
1903 年，一座由曾在新市场战斗并受伤的 VMI 学员摩西·埃齐基尔 (Moses Ezekiel) 雕刻的雕像落成，名为“弗吉尼亚哀悼她的死者”。十名倒下的学员中的六名现在被埋葬在雕像后面的 …
