School），坐落于其第一任校长亚伯拉罕·皮尔森的家乡——现在的康涅狄格州克林顿镇上。大学后搬迁到旧塞布鲁克，接着到了韦瑟斯菲尔德，最后终在1718年移到了现今的所在地纽希文市。
与此同时，哈佛的第六任校长因克瑞斯·马瑟与学校其他的神职人员关系不和，马瑟认为这些神职人员过于自由、定下的教规过于宽松以及教政体制过于宽大。这种敌对的关系导致马瑟转向支持这所新成立的学院，希望这所学院能实现他眼中的、最正统的清教思想体制。
1718年，殖民地首长的指令下，因克瑞斯·马瑟的儿子科顿·马瑟联系了一名在威尔斯发展得不错的商人伊利胡·耶鲁，祈求对方能给予财政援助以扩建这所新成立的学院。最后，在当时第一名重要人物耶利米·达默（Jeremiah Dummer）的说服下，这位曾在印度贸易中得到了不少财富的不列颠东印度公司总裁终于答应捐出9包货物及417本书籍，另也有一幅英国国王乔治一世的扫描画像。那些货物后来被换成了560块英镑，这在当时而言，是非常大的一笔财产。科顿·马瑟建议将学院的名字改为“耶鲁学院”，以表示对伊利胡·耶鲁的谢意，并希望透过此举让伊利胡·耶鲁给予更多的捐赠。
==== 课程 ====
耶鲁曾受到大觉醒运动及启蒙时代这两个大型知识分子运动所影响。尽管当时存在外有战乱内有顽劣学生及凌乱的课程编制等不明朗因素，耶鲁在校长托马斯·卡尔（Thomas Clap）及以斯拉·斯蒂尔斯（Ezra Stiles）的带领下，还是进行了科学课程的改革，这都归功于两位校长对宗教及科学的浓厚兴趣及研究。
一些神学及宗教学的学生视希伯来文为古典语言之一，与希腊文及拉丁文有着相同的地位，并有助于解读旧约圣经。这个观点得到以斯拉·斯蒂尔斯的支持。他在任耶鲁校长期间，要求所有入学的新生必须修读希伯来文，指这会成为学生以后解读圣经的一大工具。此做法跟当时只要求高级神职人员修读希伯来文的哈佛刚好相反。以斯拉·斯蒂尔斯也为耶鲁校徽提笔写下了希伯来文校训。
以斯拉·斯蒂尔斯在1779年遇上了最大的挑战。当时驻守的英军威胁要拆掉学院，幸好后来耶鲁的一名校友、时下的英军司令参谋埃德蒙·范宁（Edmund Fanning）出面请求，学院才获得保留。范宁后也获耶鲁颁发荣誉法学博士（L.L.D），以表其功。
==== 学生 ====
作为当时康涅狄格州唯一的学院，耶鲁的学生都是当时的精英。任何学生参与纸牌赌博游戏、到访酒馆、破坏学校财产及不遵守规矩都会受到惩罚。当时哈佛的教师多为比较成熟，而耶鲁的则刚好相反，以年轻并对这职业充满热情的年轻人为主。
耶鲁第一个学生社团于1738年开办。社团的功用是为学生提供一个讨论的平台，大家相聚在一块交流有关当代文学及政治的看法。
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